Mikołajki leżą nad niewielkim Jeziorem Mikołajskim. Toczy się tu życie zarówno miejskie, jak i turystyczne. Rozwinięta jest baza noclegowa. Nad jeziorem jest Port Żeglugi Mazurskiej, skąd można popłynąć do Giżycka, Mikołajek i Rynu.

Flota „Żeglugi Mazurskiej” liczy obecnie 10 statków, które mogą przewieźć jednorazowo wycieczki ponad tysiąc osób.
Wycieczkowe statki to Derkacz, Kisajno,
Śniardwy, Dargin, Bełdany, Kormoran, Roś, Tałty, Niegocin oraz Wigry. Wyruszają one na wspaniałe rejsy po mazurskich wodach z przystani w Rucianem – Nidzie, Giżycku, Rynie, Mikołajkach, Rydzewie oraz Węgorzewie. 

Jdnym z najbardziej znanych portów na Mazurach jest Wioska Żeglarska Mikołajki. Znajduje się na szlaku Wielkich Jezior Mazurskich, nad brzegiem Jeziora Mikołajskiego i jest jednym z bardziej nowoczesnych. 
Wioska oferuje:
– 250 miejsc cumowniczych,
– keję rezydencką
– stację benzynową dla jachtów,
– restauracje w porcie
– luksusowe zakupy
– wypożyczalnię rowerów
– scenę i halę koncertową – Club Namiot,

Tropikana Aquapark znajduje się w Mikołajkach, w Hotelu Gołębiewski.

Park Wodny Tropikana to przede wszystkim baseny:
basen sportowy
basen rekreacyjny z falą
basen letnio-zimowy z hydromasażami 
basen rzeka
brodzik dla dzieci
baseny zewnętrzne, 

Inne atrakcje to:
sauny: parowa i suche o nutach zapachowych: świerku, eukaliptusa, ziół alpejskich
wanny jacuzzi
tężnie
jaskinia śnieżno-lodowa
jaskinia solna
zjeżdżalnia „cebula”
siłownia
Park Wodny Tropikana czynny codziennie w godz. 8.00-21.00